Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms