Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfsf13Q9D777 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfsf13Q9D777 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfsf13Q9D777 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfsf13Q9D777 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfsf13Q9D777 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfsf13Q9D777 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfsf13Q9D777 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfsf13Q9D777 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfsf13Q9D777 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfsf13Q9D777 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfsf13Q9D777 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfsf13Q9D777 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfsf13Q9D777 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfsf13Q9D777 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfsf13Q9D777 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tnfsf13Q9D777 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tnfsf13Q9D777 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tnfsf13Q9D777 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnfsf13Q9D777 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms