Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6P8

Calml3, Calmodulin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calml3Q9D6P8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Calml3Q9D6P8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calml3Q9D6P8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms