Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J5

Ndufb8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb8Q9D6J5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufb8Q9D6J5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb8Q9D6J5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.7 ms