Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cmtm5Q9D6G9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmtm5Q9D6G9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms