Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptp4a3Q9D658 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ptp4a3Q9D658 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptp4a3Q9D658 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptp4a3Q9D658 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptp4a3Q9D658 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptp4a3Q9D658 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptp4a3Q9D658 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptp4a3Q9D658 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptp4a3Q9D658 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptp4a3Q9D658 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptp4a3Q9D658 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptp4a3Q9D658 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptp4a3Q9D658 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptp4a3Q9D658 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptp4a3Q9D658 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptp4a3Q9D658 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptp4a3Q9D658 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptp4a3Q9D658 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptp4a3Q9D658 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptp4a3Q9D658 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptp4a3Q9D658 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptp4a3Q9D658 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptp4a3Q9D658 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptp4a3Q9D658 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptp4a3Q9D658 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptp4a3Q9D658 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptp4a3Q9D658 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptp4a3Q9D658 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms