Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc39Q9D5Y1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc39Q9D5Y1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms