Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc130Q9D516 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms