Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox2aQ9D4Y3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox2aQ9D4Y3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms