Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Phf6Q9D4J7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Phf6Q9D4J7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf6Q9D4J7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf6Q9D4J7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf6Q9D4J7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf6Q9D4J7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf6Q9D4J7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf6Q9D4J7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf6Q9D4J7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf6Q9D4J7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf6Q9D4J7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf6Q9D4J7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf6Q9D4J7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf6Q9D4J7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf6Q9D4J7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf6Q9D4J7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf6Q9D4J7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf6Q9D4J7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf6Q9D4J7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf6Q9D4J7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf6Q9D4J7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf6Q9D4J7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Phf6Q9D4J7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Phf6Q9D4J7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Phf6Q9D4J7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Phf6Q9D4J7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf6Q9D4J7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms