Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lonrf3Q9D4H7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms