Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3N5

5430402E10Rik, RIKEN cDNA 5430402E10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430402E10RikQ9D3N5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
5430402E10RikQ9D3N5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms