Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stag1Q9D3E6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms