Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D1F3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D1F3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D1F3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D1F3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D1F3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D1F3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D1F3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D1F3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q9D1F3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms