Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D6

Cthrc1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cthrc1Q9D1D6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cthrc1Q9D1D6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms