Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ube2cQ9D1C1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms