Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms