Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Hddc3Q9D114 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Hddc3Q9D114 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hddc3Q9D114 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Hddc3Q9D114 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms