Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem53Q9D0Z3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem53Q9D0Z3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem53Q9D0Z3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem53Q9D0Z3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem53Q9D0Z3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem53Q9D0Z3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem53Q9D0Z3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem53Q9D0Z3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem53Q9D0Z3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem53Q9D0Z3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem53Q9D0Z3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem53Q9D0Z3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem53Q9D0Z3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem53Q9D0Z3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem53Q9D0Z3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem53Q9D0Z3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem53Q9D0Z3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms