Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0U9

Arv1, Protein ARV1, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arv1Q9D0U9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arv1Q9D0U9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arv1Q9D0U9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arv1Q9D0U9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arv1Q9D0U9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arv1Q9D0U9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arv1Q9D0U9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arv1Q9D0U9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arv1Q9D0U9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arv1Q9D0U9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arv1Q9D0U9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arv1Q9D0U9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arv1Q9D0U9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arv1Q9D0U9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arv1Q9D0U9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arv1Q9D0U9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arv1Q9D0U9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arv1Q9D0U9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arv1Q9D0U9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arv1Q9D0U9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arv1Q9D0U9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arv1Q9D0U9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arv1Q9D0U9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arv1Q9D0U9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms