Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc47Q9D024 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
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