Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ9

Dnajc18, DnaJ homolog subfamily C member 18, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc18Q9CZJ9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnajc18Q9CZJ9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dnajc18Q9CZJ9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dnajc18Q9CZJ9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnajc18Q9CZJ9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnajc18Q9CZJ9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnajc18Q9CZJ9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnajc18Q9CZJ9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnajc18Q9CZJ9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnajc18Q9CZJ9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnajc18Q9CZJ9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnajc18Q9CZJ9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnajc18Q9CZJ9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnajc18Q9CZJ9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnajc18Q9CZJ9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnajc18Q9CZJ9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnajc18Q9CZJ9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms