Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ69

Cmtm6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm6Q9CZ69 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm6Q9CZ69 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm6Q9CZ69 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm6Q9CZ69 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm6Q9CZ69 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm6Q9CZ69 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm6Q9CZ69 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm6Q9CZ69 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm6Q9CZ69 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm6Q9CZ69 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm6Q9CZ69 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm6Q9CZ69 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm6Q9CZ69 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm6Q9CZ69 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cmtm6Q9CZ69 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cmtm6Q9CZ69 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cmtm6Q9CZ69 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cmtm6Q9CZ69 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cmtm6Q9CZ69 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cmtm6Q9CZ69 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cmtm6Q9CZ69 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm6Q9CZ69 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm6Q9CZ69 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms