Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW6

3100002H09Rik, RIKEN cDNA 3100002H09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3100002H09RikQ9CXW6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
3100002H09RikQ9CXW6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
3100002H09RikQ9CXW6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms