Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PmpcbQ9CXT8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PmpcbQ9CXT8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PmpcbQ9CXT8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PmpcbQ9CXT8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms