Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX92

Gje1, Gap junction epsilon-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gje1Q9CX92 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gje1Q9CX92 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gje1Q9CX92 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gje1Q9CX92 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gje1Q9CX92 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gje1Q9CX92 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gje1Q9CX92 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gje1Q9CX92 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gje1Q9CX92 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gje1Q9CX92 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gje1Q9CX92 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gje1Q9CX92 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gje1Q9CX92 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gje1Q9CX92 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gje1Q9CX92 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gje1Q9CX92 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gje1Q9CX92 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gje1Q9CX92 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gje1Q9CX92 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gje1Q9CX92 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gje1Q9CX92 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gje1Q9CX92 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gje1Q9CX92 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gje1Q9CX92 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gje1Q9CX92 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gje1Q9CX92 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gje1Q9CX92 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gje1Q9CX92 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gje1Q9CX92 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gje1Q9CX92 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gje1Q9CX92 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms