Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddx28Q9CWT6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms