Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms