Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms