Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms