Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d3Q9CSV6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms