Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pard3bQ9CSB4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pard3bQ9CSB4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pard3bQ9CSB4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pard3bQ9CSB4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pard3bQ9CSB4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pard3bQ9CSB4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pard3bQ9CSB4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pard3bQ9CSB4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pard3bQ9CSB4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pard3bQ9CSB4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pard3bQ9CSB4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pard3bQ9CSB4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pard3bQ9CSB4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pard3bQ9CSB4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pard3bQ9CSB4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pard3bQ9CSB4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pard3bQ9CSB4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pard3bQ9CSB4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pard3bQ9CSB4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pard3bQ9CSB4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pard3bQ9CSB4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pard3bQ9CSB4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pard3bQ9CSB4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms