Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5sQ9CRA7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5sQ9CRA7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5sQ9CRA7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5sQ9CRA7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5sQ9CRA7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5sQ9CRA7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5sQ9CRA7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5sQ9CRA7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5sQ9CRA7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5sQ9CRA7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5sQ9CRA7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5sQ9CRA7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5sQ9CRA7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5sQ9CRA7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5sQ9CRA7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5sQ9CRA7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5sQ9CRA7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5sQ9CRA7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5sQ9CRA7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5sQ9CRA7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5sQ9CRA7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5sQ9CRA7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5sQ9CRA7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5sQ9CRA7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5sQ9CRA7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5sQ9CRA7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms