Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atp5f1Q9CQQ7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms