Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccer1Q9CQL2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms