Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rdm1Q9CQK3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms