Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms