Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trappc5Q9CQA1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc5Q9CQA1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc5Q9CQA1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc5Q9CQA1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc5Q9CQA1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc5Q9CQA1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc5Q9CQA1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc5Q9CQA1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc5Q9CQA1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc5Q9CQA1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc5Q9CQA1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc5Q9CQA1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc5Q9CQA1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc5Q9CQA1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc5Q9CQA1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc5Q9CQA1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc5Q9CQA1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc5Q9CQA1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc5Q9CQA1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc5Q9CQA1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms