Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CQ90 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CQ90 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQ90 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQ90 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CQ90 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQ90 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQ90 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms