Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ubl4bQ9CQ84 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms