Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ70

H2afb1, Histone H2A-Bbd type 1, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afb1Q9CQ70 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2afb1Q9CQ70 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2afb1Q9CQ70 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2afb1Q9CQ70 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2afb1Q9CQ70 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2afb1Q9CQ70 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2afb1Q9CQ70 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2afb1Q9CQ70 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2afb1Q9CQ70 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2afb1Q9CQ70 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2afb1Q9CQ70 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms