Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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