Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc198Q9CPZ1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.6 ms