Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg3Q9CPX6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms