Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf8Q99PV0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms