Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rims1Q99NE5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rims1Q99NE5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms