Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms