Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a6dQ99N07 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms