Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tdrd1Q99MV1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms