Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp16Q99LG0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms